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Google DeepMind发布AlphaGenome2预测DNA变异

Google DeepMind发布了AlphaGenome2,这是一款预测DNA序列变异如何影响人体特定细胞的AI模型。

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AlphaGenome2通过架构重构实现了对特定细胞DNA变异的精准预测,无需重训即可泛化到新数据,这是生物计算领域的重大能力跃迁,值得关注。

Google DeepMind发布了AlphaGenome2,这是一款预测DNA序列变异如何影响人体特定细胞的AI模型。

科学家以往很难预测微小的DNA变异会对具体细胞产生什么影响,这让寻找复杂疾病的根源变得极为困难。

为了解决这个问题,Google DeepMind团队彻底重构了原有模型架构。AlphaGenome2现在会在读取DNA序列时,同步获取特定的细胞类型或状态信息作为输入条件。团队利用超过1.07亿个单细胞特征数据对该模型进行了全面训练。

AlphaGenome2最终识别出能改变基因表达的致病变异数量几乎是以前的两倍。它最大的突破在于可以直接分析全新的单细胞实验数据而无需重新训练。例如在新冠疫苗研究中,它成功区分了激活的免疫细胞与静息细胞,并准确找出了在细胞激活状态下破坏性更强的新冠致病变异。这项技术能帮助医学界精准定位致病变异以及起作用的具体细胞,为复杂疾病的药物研发提供关键线索。

按照惯例,这类模型谷歌后续发布论文后会开源。

官方介绍:https://deepmind.google/blog/alphagenome-2-deciphering-how-cells-read-dna-to-better-understand-disease/

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